新疆自古以来就是我国领土中不可分割的一部分，在清朝末年的时候，新疆伊犁曾被沙俄占领，其他大部分地区被阿古柏占领，但是在左宗棠的努力下，终于将新疆全部收复。民国时期，虽然苏联一直都觊觎新疆，但是新疆也一直没有分裂出去。
解放战争末期，在新疆省主席包尔汗，新疆警备区司令陶峙岳还有解放军一些高级将领的努力下，新疆实现了和平解放。新疆刚解放的时候，当时中国和苏联的关系非常好，而且中国缺乏中亚语系的教科书，所以当时新疆用的还都是苏联出版的书籍，这对加强新疆各族人民的国家认同感很不利。1959年，中苏关系开始恶化，苏联开始向新疆地区渗透大批间谍。
当时苏联策反了新疆很多的高级将领，包括当时中国最年轻的两位少将，祖农也太夫和马尔果夫少将。这二人是新疆军区的重要领导干部，他们利用自己特殊的身份游走在各个农牧场，策反当地的百姓叛逃苏联，有大批的牧民到苏联领事馆领取了侨民证。
1962年4月22日到25日，连续三天三夜，先后有六七万牧民拖家带口的向苏联涌去。这次叛逃事件对中国造成了很大影响，使得40多万亩土地得不到耕种，很多的基层单位解体，一些县逃的就剩下几十个人，遍地都是无主的牛羊。后来新疆生产建设兵团进驻这些地区，将这些地区控制了下来。这些人很多都没有什么文化，所以很多都是被分到了哈萨克斯坦还有周边的几个中亚国家。苏联解体之后，卢布形同废纸，物价飞涨，这些牧民的生活更加艰难，有三万多人涌到霍尔果斯口岸想要回家，但是被拒绝。
